菜鸟小白 学习数据分析，很多人都是从R语言开始入门了，学习R语言的第一步其实就是要学习如何装包，还记得我当年学R的时候，那时候bioconductor版本还是3.14，3.15的版本，不知不觉间都已经更新到3.21版本了。 在安装Bioconductor包在线安装是公认比较简单的方式，但是默认安装的都是最新版本的，当然最新版本没有什么问题，我们也很喜欢，因为在线安装命令的方式很简单。 这里以GSVA包为例 if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install('GSVA') 直接这样安装成功后，在运行GSVA包的时候，经常遇到这样的报错 包括我们之前写的一些套路课程的代码也是一样的，这种报错，到底是因为什么呢？ GSVA包版本太新，新版本的函数使用方法不一样了，导致这一报错的产生。有的用户比较着急，我们会推荐已经配置好的环境直接去跑（那就是直接租共享服务器）。 不着急的用户，我们会推荐自己尝试手动进行安装，如何操作呢？小编尝试网上搜了一堆的教程，但是没有系统的方法去介绍，怎么去手动安装指定版本的R包。 首先，我们需要知道，我们安装的GSVA包是什么版本的，如这里我们选择的是1.46版本的 首先进入网址，这里的3.15是bioconductor的版本 https://mghp.osn.xsede.org/bir190004-bucket01/index.html#archive.bioconductor.org/packages/3.15/bioc/src/contrib/Archive/GSVA/ 看看有没有自己需要的版本，如果没有，就对3.15进行修改，3.16,3.17,3.14等等，直到找到自己需要的版本 但是很遗憾，在3.16版本下应该有1.46版本的GSVA包的压缩包，但是没有，这个版本下，并没有进行收录，那怎么办呢？ 换个网址：果不其然我们找到了这个版本的GSVA包的压缩包，下载下来 https://bioconductor.riken.jp/packages/3.16/bioc/html/GSVA.html 记得这里下载尽量下载source版本的，该版本使用Windows，linux，mac系统下的R 下载后，手动进行安装 install.packages("GSVA_1.46.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
